图表示突变的超级增强子

研究揭示常见淋巴瘤的新病因

通过搜索之前被忽略的基因组区域,哥伦比亚癌症研究人员发现了大量导致一种常见淋巴瘤的新基因突变。

“我们的研究结果不仅表明这些突变可能导致弥漫性大B细胞淋巴瘤,而且它们确定了一种对分析其他类型肿瘤有用的方法,”他说里卡多。Dalla-Favera他是哥伦比亚大学瓦格洛斯内科和外科医生学院癌症遗传学研究所所长,领导了这项研究研究

弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)是最常见的人类血液恶性肿瘤类型,生长迅速,侵袭性强。虽然治疗现在可以治愈约三分之二的患者,但剩下的患者预后较差,需要新的治疗策略。

到目前为止,研究人员对DLBCL的了解是基于在基因组的蛋白质编码基因中发现的导致淋巴瘤的突变。这是一个合乎逻辑的起点,因为这些基因包含了制造蛋白质的指令(或代码),而蛋白质完成了细胞的大部分功能。

但是98%的人类基因组不包含制造蛋白质的代码。非编码DNA以前被错误地描述为“垃圾”,现在人们知道它有许多功能,包括在基因表达调节中发挥关键作用。

在这项新的研究中,哥伦比亚大学的研究人员发现,在90%以上的弥漫大b细胞淋巴瘤中,非编码基因组的某些区域——被称为“超级增强子”——发生了突变,这可能是维持癌症的必要条件。超级增强子控制同一染色体上一个或多个基因的表达。

新研究中发现的突变超级增强子激活了几种致癌基因。研究人员提供的证据表明,在这些不同的超级增强子中,特定的周期性突变的基因校正恢复了致癌基因的调控,并导致肿瘤死亡,这表明肿瘤依赖于突变的超级增强子。

这些发现还揭示了DLBCL背后的遗传复杂性的新水平,这可能有助于解释为什么这种癌症有许多不同的亚型和不同的行为。

参考文献

更多的信息

Riccardo Dalla-Favera,医学博士,Percy and Joanne Uris临床医学教授,病理与细胞生物学、遗传学与发展学、微生物学与免疫学学系教授。他是癌症遗传学研究所的主任和赫伯特·欧文综合癌症中心的成员。

这项研究发表在《自然》杂志上,其标题为:超增强子高突变改变B细胞淋巴瘤癌基因表达."

其他贡献者有:Elodie Bal(哥伦比亚),Rahul Kumar(以前在哥伦比亚,目前在印度理工学院),Mohammad Hadigol(罗格斯大学),Antony B. Holmes(哥伦比亚),Laura K. Hilton (BC癌症研究中心),Jui Wan Loh(罗格斯大学),Kostiantyn Dreval(西蒙弗雷莎大学),Jasper C. h Wong (BC癌症研究中心),Sofija Vlasevska(哥伦比亚),Clarissa Corinaldesi(哥伦比亚),Rajesh Kumar Soni(哥伦比亚),Katia Basso(哥伦比亚),Ryan D. Morin(西蒙弗雷莎大学),Hossein Khiabanian(罗格斯大学)和Laura Pasqualucci(哥伦比亚大学)。

该研究得到了美国国立卫生研究院的资助(R35-CA210105、R01-CA172492和R01-CA233662)、阿斯利康学者奖、赫伯特·欧文综合癌症中心速度奖和V基金会的转化资助。

Dalla-Favera博士是NeoGenomics的科学顾问委员会成员和AstraZeneca的顾问。本文报道的工作与这些公司目前的活动无关。