五个VP&S团队授予阴道精密医学补助金

年度Vagelos精密药试点补助金已被授予五个VP&S研究人员,进行创新的基础科学,翻译和临床研究,这些疾病从新的癌症治疗到卫生差异研究。

五支球队的领导者:

  • Srilaxmi Bearelly,MD,眼科副教授
  • Brian Henick,MD,医学助理教授
  • 何志民,博士,微生物学与免疫学助理教授
  • 玉峰沉,博士,系统生物学和生物医学信息学副教授
  • 薛冰吴,博士,系统生物学和医学助理教授

The Vagelos Precision Medicine Pilot Grants—jointly awarded by the Columbia Precision Medicine Initiative, the Herbert Irving Comprehensive Cancer Center, and the Irving Institute for Clinical and Translational Research—underscore Columbia’s commitment to supporting diverse, cross-disciplinary research to realize the promise of precision medicine.

该计划是由Roy和Diana Vagelos的慷慨捐赠,以支持精密药领域的开创性基础研究。每个研究团队在一年内收到100,000美元的资金。下面列出的研究人员团队将在秋季2022年秋季的精密药物奖项中展示其项目。


视网膜成像和深度学习,以确定产妇风险和减少种族差异

铅研究员:Srilaxmi Bearelly,MD
共同调查人员:罗纳德Wapner,MD, 和安德鲁莱恩,DSC

眼睛背后的图片有助于我们理解疾病和健康的血管变化。本研究的主要目的之一是了解如果在先兆子痫发育前视网膜中的血管发生变化。预口度是妊娠的严重疾病,可能导致发病率和死亡率,种族和少数民族更常见。在早期预临床前阶段中有一个巨大的未满足,以防止死亡率。视网膜成像(眼睛背后的照片)是无侵入性的,不需要扩张,并且涉及患者的最小风险。它将在1,500个怀孕的受试者上进行。目标是定制产前医疗保健(预防,诊断和最终治疗该疾病)。


患者衍生的有机体模拟和操纵食管腺癌中的肿瘤调节依赖性

铅研究员:Brian Henick,MD
共同调查人员:德里亚加瑞那诺,博士;赵璐,博士;和Hiroshi Nakagawa,MD

患有晚期/转移性食管腺癌(EAC)的患者尽管新的药物批准,但也许是因为EAC实际上代表了不容易与常规技术可区分的多种癌症亚型。研究肿瘤RNA,Califano实验室已经开发出可基于机械控制肿瘤细胞的转录状态的常规调节因子(MR)蛋白质的差异差异的EAC亚型算法的算法,其可用于在模型系统中确认。遗传地操纵MRS,或用CLIA认证的动脉释放算法鉴定的药物,可以帮助将现有的药物用于逐案的案例基础上用于EAC亚型。通过这种方法测试肿瘤模型中的药物疗效可以同时为多个EAC亚型识别有希望的新疗法。患者衍生的有机体(PDO)是一种有效的模型系统,可以重新承载肿瘤生物学和治疗反应的可能性。在Nakagawa实验室中,团队计划确认人体EAC与其派生的PDOS股份。鲁实验室将通过实验淘汰预测,预测在每个PDO中最为必要,最后测试一种药物,以确定最有可能使每个EAC亚型有益的人。


使用冷冻电子断层扫描直接可视化疟疾寄生虫侵袭

铅研究员:Chi-min,博士
共同调查员:David Cobb,PHD

世界上有一半的人口有疟疾的危险,每年导致超过400,000人死亡。疟疾是由疟疾寄生虫引起的,使我们通过入侵和复制我们的红细胞而生病。为了进入人红细胞,疟疾寄生虫,疟原虫疟原虫组装大蛋白质复合物,其与宿主红细胞表面上显示的蛋白质受体结合。这些大型入侵复合物对于寄生虫能够连接并进入红细胞是必不可少的。这些入侵复合物的组分是开发新的抗疟疾疗法和疫苗的吸引力。不幸的是,综合体是短暂的,使它们难以分离用于结构和功能研究。何浩和Cobb旨在通过利用原位冷冻电解层析成像的最近进步来克服这一障碍,直接可视化捕获人红细胞行为捕获的疟疾寄生虫的冷冻样本中的全侵入机械。


通过机器学习,开发新的计算方法来预测蛋白质结构的畸形变体的功能影响

铅研究员:俞丰沉,博士
研究员:穆罕默德·阿克什里,博士学位

对基因组变异的准确和可扩展解释是实现人类遗传和基因组中的高通量测序的全部潜力的关键组分。密码变体占大多数蛋白质编码变体,具有潜在的巨大功能影响;然而,他们中的大多数都没有促进疾病。无法准确地预测其功能影响是识别遗传研究研究中风险基因的关键障碍。该项目旨在通过利用最新机器学习方法,蛋白质结构和各种群体的大型基因组序列数据来开发新的计算方法来预测密码变体的功能影响。所提出的方法将改善基因组测序的效用,并在遗传学研究和临床诊断中实现新的发现。


心脏中的一种特殊核糖体:了解核糖体蛋白RPL31中的突变如何通过使用患者衍生的IPSC和遗传工程的小鼠引起新生儿扩张的心肌病变

铅研究员:Xuebing Wu博士
共同调查人员:史蒂文马克思,医学博士;特蕾莎李,米德;和Mythily Ganapathi博士

基因中的突变会导致婴儿的严重心力衰竭。我们尚未完全理解哪些基因会导致婴儿心力衰竭以及驱动器。吴队最近发现了RPL3L基因中的这种突变,其编码了核糖体的组分,该机器负责解码遗传信息和在每个细胞中制备蛋白质的机器。虽然科学家最初认为每个人细胞都有相同的核糖体,但事实证明,心脏和骨骼肌细胞中的核糖体不同,因为它们用RPL3L取代另一种蛋白质。该项目将通过使用患者衍生的干细胞和遗传工程的小鼠模型来研究特殊核糖体的分子和细胞机制。该项目的目标是帮助阐明为什么心脏和肌肉细胞需要特殊的核糖体,并了解突变如何导致婴儿心力衰竭。