DNA得到了它的沟槽

简单的生活行为需要我们25000个基因中的每一个都在正确的时间和地点开启。

遗传密码被认为控制基因的激活,但哥伦比亚大学的科学家们在一篇新论文中发现,DNA螺旋的形状可能同样重要。这一发现将有助于人们了解致病基因是如何被激活的,同时也有助于开发出抑制致病基因的新疗法。

DNA沟槽的宽度有助于控制基因的激活。这一发现将帮助科学家们发现致病基因是如何启动的以及如何关闭它们。启动一个基因的过程是一个巨大的身体挑战。一个DNA结合蛋白必须扫描30亿个DNA碱基对,以找到一个精确的点,大约6个碱基对长,在那里它附着并打开基因。几十年来,人们一直认为碱基的线性序列(即AATCGCTATGC)可以告诉蛋白质附着的位置。

在10月29日发表的一篇论文中。生物化学与分子生物物理系的Richard Mann, Barry Honig, Remo Rohs, Sean West和Peng Liu发现DNA结合蛋白通常利用DNA螺旋小沟槽的宽度来识别它们的结合位点。

这一发现可能解释了为什么所有计算机模拟定位基因组中每个结合位点的尝试都失败了。“当蛋白质阅读DNA时,它们阅读的不仅仅是一串字母,它们阅读的是DNA螺旋的形状,”曼恩说。“而过去人们并没有对此给予足够的重视。”

研究人员说,通过整合形状,计算机模型在未来可能会变得更精确。有了更准确的预测,研究人员将在了解致病基因如何启动以及发现关闭它们的新疗法方面取得更快的进展。

想了解更多关于这项研究的信息,请访问http://www.hhmi.org/news/honig20091029.html.巴里·霍尼格(Barry Honig)是霍华德·休斯医学研究所(Howard Hughes Medical Institute)的研究员,也是计算生物学和生物信息学中心的主任。

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Barry Honig, Computational Biology, DNA, Peng Liu, Remo Rohs, Sean West