着色的人类细胞(粉红色)严重感染了SARS-COV-2病毒颗粒(绿色)/ NIAID

在纽约市地区发现了新的“本土”冠状病毒变体

根据科学家在哥伦比亚大学Vagelos医师学院的研究员的研究,新的SARS-COV-2与其他最近令人担忧的变体股票的血统相似,这是纽约市的崛起。

学习尚未对同行评审,已发布在预印刷服务器Medrxiv上。

到目前为止,在包括康涅狄格州和威斯彻斯特县的三国地区的患者中,已经确定了超过80例的家庭成长变体患者。

自2020年11月首次出现在采集的样本中以来,被称为b .1.526的新变异病毒的流行率一直在稳步上升。2021年1月,B.1.526占研究人员分析的样本的约3%,到2月中旬升至12.3%。他们发现的病例分布在整个纽约市地区。

研究人员还搜索了公开的数据库,并发现了B.1.526造成的Covid-19案例,并且密切相关的菌株主要在美国东北部门出现,如最近发布到BiorXiv的研究中的其他研究人员所建议的。

“这不仅仅是一个集群,这意味着血统可能在该地区广泛传播,”Anne-Catrin Uhlemann,MD,博士,医学副教授在传染病划分,谁带领研究大卫何他是亚伦·戴蒙德艾滋病研究中心主任和克莱德' 56和海伦·吴医学教授。

研究人员从今年1月开始在纽约地区的担忧变异中寻找关键突变,并分析了1100多个样本。“一开始,我们以为我们能找到很多其他已知的世系,”乌勒曼说。虽然检测到了最初在南非和巴西发现的一些变异,但“我们没有发现我们预期的高数量。”相反,我们发现这种土生土长的血统数量很多,”她说。

与其他类型的担忧相似

新的B.1.526变体对传播性,疾病严重程度和重新感染风险的影响尚不清楚。

但哥伦比亚的研究表明,B.1.526 B.1.526与B.1.351,南非首先识别的变体股份,第1次持续担心,并在巴西首次鉴定,这对某些治疗和疫苗易受敏感。

主要关注的是病毒穗蛋白的一个区域的变化,称为E484K,其在所有三种变体中存在。据信E484K突变削弱了身体对病毒的免疫应答。

最近学习由何发现疫苗的抗体在中和B.1.351病毒中的抗体较低 - 并且效果主要由E484K突变引起。

他发现,E484K突变也是负责的,对于对B.1.351变体的某些单克隆抗体治疗的有效性降低。

具有E484K突变的变异也可能导致以前感染过该病毒早期变异的人再次感染。在目前的报告中,一名感染了新的B.1.526变种的人之前有记录的SARS-CoV-2感染,但没有E484K突变,研究人员目前正在努力确定这一本地谱系的潜在起源。

下一步是什么?

在未来几周内,科学家们计划将测序努力加速为每天约100个样本,以继续监测新的变体,包括B.1.526。

“我们还发现了许多案例的B.1.1.7变体,最初在U.K中识别,有可能的情况是双倍的,但很难知道哪些变体会导致最大的问题,”Uhlemann说。“增加我们的基因组测序努力将有助于我们更好地了解新变种的影响,并保持我们的眼睛为在我们所在地区出现的新变种。”

研究人员还在努力培养活变形,以了解其对疫苗和单克隆抗体治疗的脆弱性及其重新感染的潜力。

Ho说:“这些变异的增加表明,我们可能需要一段时间来追逐SARS-CoV-2。”“不幸的是,随着疫苗的出现,这场大流行可能不会轻易消失。”

“It’s worrying that in the New York City region, case numbers don’t seem to be declining as rapidly as in other areas of the country,” Uhlemann says, “Physical distancing and masks will slow the spread of all variants, and we need to double down on those efforts.”

参考文献

更多信息

本文,标题为“一个新的SARS-COV-2令人担忧的变体B.1.526,在纽约鉴定,“2月25日在线出现在Medrxiv。

其他作者(均来自哥伦比亚)有Medini K. Annavajhala, Hiroshi Mohri, Jason E. Zucker, zizzhang Sheng, Pengfei Wang, angela Gomez-Simmonds。