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成千上万的人的新分析表明,遗传变化以前认为毫无意义,或“沉默”实际上可能在患者疾病中发挥重要但忽略的作用,包括乳腺癌。
当20世纪60年代的研究人员破裂了DNA代码时,首先发现了这些无声的遗传变化。DNA给出细胞用于在3字母段中制作蛋白质的指令,称为密码子;每个3字母密码子对应于蛋白质中的特定氨基酸。
但具有64种可能的密码子和仅20个氨基酸,大多数氨基酸由几个不同的密码子编码。冗余意味着一些DNA突变不会改变蛋白质的氨基酸序列。
遗传学家通常忽略了这些同义的DNA突变。然而,最近的研究表明,同义突变可以影响产生的蛋白质;所谓的“最佳”密码子对于细胞来过程更快,并导致蛋白质产生增加。
测试同义突变并非毫无意义的想法需要大量的遗传数据,这些遗传数据只有最近可用,因为更多人将其基因组测序。
在新的学习,Ryan Dhindsa,Phd和David Goldstein,Phd,哥伦比亚大学基因组医学研究所和同事们分为含有近200,000人基因组的数据库,发现了自然选择有利于改善最优性的同义突变的第一证据。
“我们发现减少密码子最优性的同义突变在人口中的比例突出得多,而不是增加最优性的同义突变,”Dhindsa说。“表明同义突变是在选择性压力下,我们已经知道基因组的区域在选择性压力下通常对人类健康重要。”
更接近的基因逐基因分析证实,对同义密码子的变化更不耐受的基因包括与癌症相关的那些,以及当它们的表达水平变化时引起疾病的那些。
例如,在BRCA1中,该研究发现,众所周知的众所周知,众所周知,该研究发现,降低密码子最优性的突变可能影响编码蛋白的水平并可能在疾病中发挥重要作用。
对于希望审查沉默密码子在其他基因中的作用的其他研究人员来说,Dhindsa创造了不宽松的分数,评估了每个基因中同义密码子的重要性。
“这些分数将有助于我们定位其他潜在基因,其中改变密码子最佳性的同义变体也可能导致疾病,”Dhindsa说。
“自然选择在人类基因组中形成密码子使用,“发表于6月份的美国人类遗传杂志。
Ryan Dhindsa,Phd,是哥伦比亚大学Vagelos医师和外科医生的MD /博士学生。
博士,博士博士,哥伦比亚大学基因组医学研究所主任,约翰E.在哥伦比亚大学哥伦比亚大学遗传学和医学院医学科学教授和医学科学教授医生和外科医生。
其他作者:Brett R.copeland(哥伦比亚大学欧文医疗中心)和安东尼M.Mustoe(贝勒医学院,德克萨斯州休斯敦)。
D.B.G.是普拉西斯股权的创始人,持有Q-StateBiosciences的股权,作为Astrazeneca的顾问,并获得了詹森,吉尔德,生物原,阿斯塔伦卡和联盟Chimique Belge的研究支持。R.S.D.作为Astrazeneca的顾问。即清即可作为Ribometrix的顾问。