PPE中的两个医生

所有的手放在桌上

哥伦比亚教师如何改变课程导航Covid-19

2020年12月23日

三月底,乔治Hripcsak他原本希望参加一个在英国举行的全球跨学科研究合作研讨会,该研讨会的协调中心由v&s运作。相反,3月26日,Hripcsak和领导委员会的其他成员观察健康数据科学和信息学(OHDSI,发音为“Odyssey”)发起了一场长达88小时的虚拟研究马拉松,来自数十个国家的300多名研究人员参加了此次活动。

“这就是我们将努力转向COVID的方式,”国际OHDSI的联席首席研究员Hripcsak说,“来自北美、欧洲和亚洲的研究人员举行了为期四天、昼夜不停的会议,共同启动了我们的COVID研究。”

自2014年以来,Hripcsak和OHDSI的其他志愿者已经积累了一个全球近6亿患者的电子健康记录和索赔数据数据库。这些数据集使他们处于一个独特的位置,可以联合努力对抗这种新疾病。有了真实世界的数据,他们开发了一项观察性研究,旨在回答有关这种新疾病的问题,例如,谁更容易得这种病?治疗工作吗?并发症的无数风险是什么?

马里兰州乔治Hripcsak
乔治Hripcsak

Hripcsak说:“在那88个小时里,我们没有睡很多觉。”但那些不眠之夜很快就产生了效果。到4月初,正在考虑单独使用羟氯喹或与阿奇霉素联合使用,作为卫生保健工作者的预防措施。Hripcsak及其同事提醒美国食品和药物管理局及其欧洲同行欧洲药监局,OHDSI数据库显示,在非COVID-19患者中,一些突然死亡与短期羟氯喹/阿奇霉素有关。最终,政府官员并没有推荐这种形式的预防。

在OHDSI工作的同时,Hripcsak在4月至6月期间发表了其他与covid相关的论文,包括一项研究由VP&S医学生特点和发表在《英国医学杂志》前1000 COVID-19患者的病程承认纽约长老会医院和发表在《新英格兰医学杂志》上的一项研究,写与约书亚Geleris,医学博士,和尼尔·施拉格医学博士证明羟氯喹在降低COVID-19患者插管和死亡风险方面无效。

随着纽约市从2020年3月开始成为大流行的中心,v&s的数十名教员利用正在进行的工作,轻快而实质性地解决了临床和调查方面的挑战,Hripcsak是其中之一。

是放射学研究中心的主任大卫布伦纳他一直在研究一种特定波长区域的紫外线(远UVC, 222纳米),他已经证明,这种光可以有效地杀死空气传播的流感病毒,但与传统的杀菌UVC光不同,它对人体直接暴露是安全的。他很快将注意力转向了引起COVID-19的冠状病毒SARS-CoV-2。在6月发表的一篇论文中,布伦纳指出,在当前监管安全限制范围内使用的远uvc光,在8分钟内灭活了90%的空气传播的冠状病毒,在约25分钟内灭活了99.9%。

Brenner说:“根据我们的结果,顶灯发出的远uvc光可以安全地用于显著降低被占用的室内空间中SARS-CoV-2的环境水平。”与传统的杀菌UVC光不同,远UVC光对人体暴露是安全的,并有可能成为人们在室内采取的其他预防措施一样必要的。“除口罩和保持社交距离外,远紫外线作为限制SARS-CoV-2和其他病毒在有人居住的室内空间传播的第三种方法具有巨大潜力。”

埃里克•格林在突然发现自己在家工作、撰写已经在筹备中的论文和拨款之后,他找到了一种支持大流行应对措施的方法。格林实验室在3月中旬被关闭,因为哥伦比亚大学和纽约大学试图“使曲线变平”,但格林想要帮忙,尤其是在他的哥伦比亚大学的许多同事在前线的情况下。“世界上最糟糕的事情就是让一个科学家呆在家里无事可做,”格林说。“我开始问人们我能帮上什么忙,我发现很多人都在想同样的问题。很快——在第一个星期内——我们就联合起来了。这才是真正有效的方法。”

埃里克格林,博士
埃里克•格林

通过v&s的小道消息,格林了解到v&s研究人员中正在兴起的草根活动。被称为坚固,哥伦比亚研究人员对抗COVID-19——在实验室关闭后,博士后们重新调整了他们的研究目标,开始了集体事业。Greene和从事胰腺癌研究的医学副教授Kenneth Olive博士成为CRAC的教员顾问。格林说:“我建议,我们应该做的一件事是建立一个全哥伦比亚范围的数据库,列出所有从事covid -19相关主题工作的人,并具体说明他们的工作内容,这只是一种相互沟通的方式。”

在早期的阶段,Greene聚集的名字Ad Hoc,然后了解到Andrea Califano,Systems Bioloology系的博士,正在做同样的事情。他们整理了他们的名单,而且数据库被CRAC团队接管,由Postdoc Haotian“Howie”吴,博士领导。

这项努力导致了更大,更广泛的项目:COVID-19虚拟座谈会,一周,每周在线讲座系列,每周八到10个演示者,从哥伦比亚和全球各地,他在Covid-19上传中最新的科学。“这是一种让人们在大学里带来的一种方式,”格林说,“并让每个人都了解对对疾病的最新理解。”

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本次虚拟研讨会由Greene, Califano, Andrew Marks, MD, Clyde ' 56和Helen Wu分子心脏病学教授,生理学和细胞生物物理学系主任,Stephen Goff,博士,微生物学和免疫学,生物化学和分子生物物理学Higgins教授主持。Greene补充说:“如果没有像博士后Ester Cynn、Jessie Brown和其他许多幕后操作人员这样的CRAC团队志愿者的真正惊人的努力,这个研讨会是不可能的。这些志愿者对整个工作的重要性再怎么强调也不为过。”

Zoom的首次研讨会于4月1日举行,有700多名哥伦比亚大学的科学家和临床医生参加。在系列节目中,发言者报告了从意大利、中国和西班牙前线收集到的知识;其他国家提供了疫苗开发和治疗的最新情况;还有一些人就与该疾病有关的不断演变的社会问题发表了评论。格林说,很多信息在发表前都被慷慨地展示了出来。“人们非常愿意分享数据,”他说。“这是令人惊讶的。”在前三个月,v&s举办了13次COVID-19虚拟研讨会,每次会议约200人参加。

伊娃张博士
伊娃张

疫情爆发一个月后,随着虚拟研讨会的启动,纽约-摩根士丹利儿童医院的临床医生注意到,一群原本健康的儿童出现了多种症状,有时甚至是严重的症状;这种情况后来被称为儿童多系统炎症综合征,简称misc。“我们必须迅速识别、调查和治疗一种影响与COVID-19相关的儿童的全新综合征,世界上很少有人了解这种综合征,”儿科重症护理医生和心脏病学家说伊娃张医学博士。

虽然MIS-C与Kawasaki病(KD)和毒性休克综合征(TSS)分享了许多特征,但张表示,这些新颖的病例率比预期更高,因此医生涉嫌新兴的东西。“平均而言,我们每隔几个月都会看到一个KD或TS的孩子,甚至更少。由于我们在另一个孩子接受了一个孩子 - 并且在Mis-C的高峰期,许多孩子一天 - 它只是与这两种疾病保持一致,“张说。“我们怀疑这与Covid-19相连。”

张某特征在于jama的案例系列中的MIS-C。她报道称综合征的主要标志是发烧伴随其他症状,如胃肠不适,恶心,呕吐,皮疹和异常胸部X射线。张先生说,这些并发症说明了关于接触Covid-19的事情引发了让孩子生病的炎症反应。

研究人员认为misc是罕见的;在纽约儿科医院接受治疗的数千名儿童中,misc只有60人被确诊,所有人都在医院接受了治疗,之后已经回家。张继续她的研究,前瞻性地监测该队列misc的长期影响。她还领导了一项正在进行的研究,与激增期间的其他机构相比,在NYP给予misc治疗,以帮助确定管理综合征的最佳方案。

与成人医学的同事一样,张某和她的MIS-C调查人员同时响应和记录策略来治疗Covid-19及其并发症,同时还调整到他们看到患者的突然转换。在NYP保健系统 - Covid的儿科案例 - 在摩根斯坦利儿童医院中集中,许多儿科专家也被重新部署以照顾成年人。“因为儿童受到Covid-19的影响,我们有能力照顾我们的城市的孩子,并对成人患者敞开大门,”她解释道。其他小儿科专家被转移到成人医院,为那里的重大关心努力做出贡献。“我不认为这个机构中有一个临床医生,他们在大流行期间没有找到不同的作用。”

Reimagination是在纽约城的大流行病峰期间通过VP&S研究计划运行的共同主题。由...领着Muredach赖利欧文临床与转化研究所(Irving Institute for Clinical and Translational Research)主任MBBCh说,研究人员围绕并加速了一个长达数年的项目。欧文研究所(Irving Institute)、基因组医学研究所(Institute for Genomic Medicine)、病理与细胞生物学学系(Department of Pathology & Cell Biology)的研究人员与包括研究办公室(Office for Research)在内的多个医学中心合作伙伴共同发起了一个机构生物比计划的更早,并且改变了重点。Reilly说:“我们计划在4月1日之前,在CUIMC登记所有同意的患者,然后主动收集样本。”“但当COVID发生时,我们迅速将重点转向纽约大学/哥伦比亚大学COVID检测呈阳性的患者,并在临床实验室完成样本后保存残留样本。”收集的样本中最常见的是血清,但也收集了其他样本:血浆、鼻咽拭子、尿液、粪便、脑脊液和浓缩的白细胞产品,称为“白大衣”,用于提取DNA。

“患者对参与这项工作非常感兴趣,”他说詹妮弗威廉姆森他与赖利和其他教员一起启动了生物样本库,并监督对患者的服务。患者愿意立即提供帮助,使生物库对COVID-19和misc研究有用。威廉姆森补充说:“虽然其他机构说,一个新建立的生物库可能需要5年时间才能产生影响,但研究人员在生物库开始后仅4个月就使用了我们的样本。”

截至6月底,约7000名当前和以前的COVID患者同意使用他们的样本——总共收集了约7万份样本,包括该国最大的纵向misc样本集之一。近2000名其他患者已同意继续参与生物样本库,并同意与他们联系进行其他研究。

“With samples from the biobank and electronic health records, we can provide patients with ongoing follow-up while also trying to answer important questions such as why some people get very sick and some don’t and why some people respond to some treatments and others don’t,” says Reilly.

来自患者护理第一线的见解为包括妇女健康在内的其他研究领域提供了信息。辛西娅Gyamfi-Bannerman,MD,母亲胎儿专家,共同撰写了在Jama发表的研究函,揭示了与感染风险增加相关的社会决定因素 - 即生活在家庭中的人数,更拥挤的家庭和一个人较低的社会经济地位 - 在3月中旬至4月中旬之间的两个NYP医院提供的孕妇。“人们可能会认为,因为纽约城是如此密集,很少有可能减缓病毒的传播,但我们的研究表明感染风险与家庭有关,而不是城市,密度,”Gyamfi-Bannerman说。

杰里米Beitler他开发、实施并发布了呼吸机共享协议,作为公共卫生防范策略,以缓解疫情最严重时预期的呼吸机短缺。通过彻底的检查和匹配的病人,这些呼吸机成功地用于支持两个人在同一时间两天。最初一系列患者的结果发表在《美国呼吸与重症监护医学杂志》(American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine)上,该方案已被全球各地的医院采用。Beitler在接受《纽约时报》采访时表示:“我们正在做一件以前从未有人做过的事情,但现在正是时候。”

研究人员表示,在疫情最严重时期成功地转向COVID-19研究,是因为各部门都有共同的使命感和团结。张说:“我们已经学会了用一种以前根本不需要的方式与同事合作。”“成人和儿童的医疗保健是非常独立的——独立的大楼,独立的医院。但每个人都调整了自己的做法,在不同的地方照顾了很多病人。这是团队合作的不可思议的展示。”

格林也有同样的感受。“看到这么多的实验室联合起来解决这个问题——包括哥伦比亚大学和世界各地的实验室——是很了不起的。我认识了很多以前没有机会接触的人,这很有价值。”

通过共同致力于抗击COVID-19形成的合作可能会持续到大流行结束之后。正如威廉姆森所说:“当你在做一件非常重要的事情时,每个人都清楚地知道任务,并专注于实现它,这是非常值得的。这是哥伦比亚最好的地方。”


这篇文章最初发表于2020年VP&S年度报告